正确设定的工厂运营业绩指标设定，能够和整个企业的业务目标一致，上下同心，还可以激发员工的工作的热情。 同时在资源有限的条件下，真正做到“好钢用到刀刃上”，准确判断工作的优先级。反之，如果不能合理地设置业绩指标，轻者会导致整个组织的效率下降，严重的甚至会错误引导员工的做事方式，从而带来不可挽回的损失。
而一旦业绩指标被确认以后，所有的运营活动都要以达成或超过业绩指标为中心。即便在日常工作中也不应该存在非常重要但和任何一项业绩指标没有关联的工作。
工厂卓越营运业绩指标的设定一般从两个方面考虑，一个是结合企业自身长远发展的业务目标，一般是未来3到5年的战略目标，找出工作重点，分解到年度的业绩指标。关于企业战略目标指定和分解的过程，可以参考“战略部署流程和工具”。
什么是战略部署流程：
战略部署流程SDP在不同的公司有不同的名字，比如方针部署Policy Deployment，或X-Matrix等。源于最初的精益Hoshin Kanri工具。主要作用就是将公司或企业的长远战略目标分解转换为中期和年度业绩指标。
工厂卓越运营指标设定的另一个参考是行业多年形成的，被验证为行之有效的指标参数。 比如，对于大多数制造行业来说，常见的工厂运营业绩指标，需要包括安全，质量，准时交付，库存，成本，员工。按英文来说，是Safety, Quality, Delivery, Inventory, Cost, People。取首字母，就是SQDICP。当然各个工厂可以根据自身的运营实际做增减。
因为企业最终的业绩指标都会在财务指标上，包括订单，销售，利润，现金流等体现出来，上面的运营的指标最终都会归结于对财务指标的贡献或影响。作为工厂运营的负责人，应该尽量将非财务的指标量化为财务的指标影响。比如，对质量指标的提升可以大大降低废品率或原材料利用率，这样直接能够降低产品的生产成本，进而扩大企业的利润。我们应该有意地将产品良率和成本下降的关联性公示出来，比如对于产品A来说，1%的良率提升相当于0.5%利润率的上涨，或对于公司来说就是每年5万人民币的利润提升。这样每位员工对于良率提升的重要性都能有直观的感觉。其它的安全，交付等指标也类似。